Hace poco, en un especial de Investigación y Ciencia sobre Misterios de la Física Cuántica, me encontré con una curiosa reseña sobre el sistema de cifrado que utilizaba el Ché Guevara para intercambiar mensajes con Fidel Castro.
Al parecer, en 1967, cuando el ejército boliviano capturó al Ché, encontraron en su poder unos borradores que podían corresponder a un mensaje que Guevara estaba cifrando.
El sistema de cifrado que utilizaban era el único que se considera a día de hoy realmente invulnerable (mientras no se obtenga la clave): la libreta de un solo uso (one-time pad)...
Lo primero que se hacía era convertir el mensaje original de texto a cifras, mediante un código preestablecido (es lo que muestra la fila superior de las tres que se aprecian en cada bloque longitudinal de la imagen). Debajo (segunda fila) se escribía la clave (una sucesión de dígitos aleatorios que sólo conocían Guevara y Castro). Por último se trazaban líneas verticales para separar las dos filas en bloques de cinco dígitos y se sumaban -sin acarreo- las filas uno y dos para obtener el mensaje cifrado (fila 3). Éste se transmitía a Cuba por un canal inseguro, como la radio de onda corta.
En la oficina de cifrado de Castro se aplicaba el método inverso: se restaba la clave y se aplicaba de nuevo el código inicial al resultado. Como medida de seguridad adicional, en el mensaje descifrado se utilizaban alias de algún diccionario prefijado que sólo conocían emisor y destinatario.

Idéntico sistema se ha seguido utilizando por los servicios secretos con algunas variaciones, por ejemplo reemplazando los dígitos decimales por binarios y realizando todas las operaciones en base 2, algo que puede ser realizado cómodamente por un ordenador. El peligro radica en el compromiso de la clave.
http://www.kriptopolis.org/el-cifrado-del-che-guevara